第五戦闘ユニット、全滅。
紅の世界と呼ばれる異世界から現れた侵略者【ナイトフライオノート】。
世界を救えるのは、若き司令官萌黄アキラ率いる第五戦闘ユニット・ＳＲ５だけ──のはずだった。
過酷な戦いの果てに、次々と命を散らしてゆくライダーたち。世界が終わろうとしたその時、アキラがとった選択とは!?
人気キャラクター甘粕ソーイチロウの目線から語られる、もうひとつのスカーレットライダーゼクス。